一、派驻机构

　　中共仲恺高新区纪律检查委员会驻东江高新科技产业园管委会（办事处）纪检组

　　中共仲恺高新区纪律检查委员会驻惠南高新科技产业园管委会（办事处）纪检组

　　中共仲恺高新区纪律检查委员会驻区两委办纪检组

　　中共仲恺高新区纪律检查委员会驻区宣教文卫办纪检组

　　中共仲恺高新区纪律检查委员会驻区科技创新局纪检组

　　中共仲恺高新区纪律检查委员会驻区财政局纪检组

　　中共仲恺高新区纪律检查委员会驻区住房和城乡规划建设局纪检组

　　中共仲恺高新区纪律检查委员会驻区农村工作局纪检组

　　中共仲恺高新区纪律检查委员会驻区市场监督管理局纪检组

　　二、内设机构

　　仲恺高新区纪律检查委员会（监察与审计局）与惠州市监察委员会派出仲恺高新区监察专员办公室合署办公，下设7个内设机构。即：办公室、党风政风监督室、纪检监察一室、纪检监察二室、案件审理室、审计一室、审计二室；下属事业单位1个，即：电子监察中心。